高架駅で、大阪環状線と桜島線の乗換駅になっています。ホームは島式2面3線から成り、中央の1線が桜島線、外側の2線が大阪環状線となっています。桜島線の列車は、停車している間に両側の扉を開放するため、大阪環状線の内回り、外回りのいずれからも同一ホームで乗り換えできます。
改札は駅の南西側(天王寺および桜島方面)の1個所のみで、高架下の2階相当の場所に設置されています。阪神西大阪線の接続駅で、改札口脇の連絡通路から、JRホームよりさらに高い場所にある阪神電車乗り場に向かうことができます。
西九条という地名は、九条と安治川を挟んだ北側の地域を指しており、行政上は此花区に属します。駅の周辺には商店が入った雑居ビルが多く建ち並んでおり、市バスが各方面へ走っています。駅の南側には、エレベーターで地下に行き来することで有名な安治川トンネルがあります。