男山山上へ向かうケーブルカーの八幡市駅は、営業上は京阪本線と同一駅になっていますが、駅舎はまったく別で構内も分かれています。改札も別々になっており、こちらにも自動改札機が設置されています。なお、山上駅には自動改札機はないので、この八幡市駅のみで乗車券のチェックを行っていることになります。
駅舎には「男山ケーブル」と大書されていますが、八幡市の駅名は見あたりません。駅玄関前にはフェンスが設置されており、乗車客の入口と下車客の出口が区分されています。
ホームは、改札正面左手が乗車用、右手が降車用というオーソドックスなものです。