2面4線から成る地上駅です。橋上駅舎ですが、駅舎は老朽化が進んでいるようで、薄暗いだけでなく煤けた印象があります。近い将来の高架化を見据えて改修などを控えているのでしょうが、特に西口は用地買収が進んでおらず、本格的な工事着手にはしばらく時間がかかりそうで、駅舎は当面このままなのでしょう。
駅周辺にはスーパーなどが建ち並んでおり活気があります。
「高石」の地名は、渡来人である高志氏の拠点だったことからついたもので、古くは「高脚」とも表記され、高師浜も同じ由来です。同氏を祭る高石神社は高師浜駅近くにありますが、高石駅からも歩いて8分ほどの距離です。