南小谷

松本から延々と北上を続けてきた大糸線は、ここ南小谷を境に南側が電化区間（JR東日本）、北側が非電化区間（JR西日本）となります。営業上でも運転系統上でも境界駅となっていますが、駅はJR東日本が管理しています。なお、南小谷以南のJR東日本区間を「大糸南線」、南小谷以北のJR西日本区間を「大糸北線」と呼ぶことがあります。

特急「あずさ」が毎日1往復発着しています（下りは千葉発、上りは新宿着）。

駅は谷がやや開けたところに位置していますが、狭いスペースをやり繰りしているような印象を受けます。

駅本屋側に単式ホーム1面1線と、さらに島式ホーム1面2線があり、両ホームの間は跨線橋で連絡しています。特急発着時には駅本屋前のホームが使われ、島式ホームはそれ以外の場合とJR西日本の気動車が使われています。現在は、臨時便を含めて南小谷の南側と北側を直通する列車は一本もなく、全便がここで折り返します。

駅舎は小ぶりな鉄筋平屋建てのものです。かつては切妻を前面に出したおとなしいデザインでしたが、その後玄関部分が増築され、山小屋の腰の部分になまこ壁をあてるという、不思議なデザインのファサードが出現しました。「みどりの窓口」があり自動券売機が設置されているほか、駅舎内をさらに区切った待合室が用意されています。

小谷村の玄関駅にして、栂池高原など同村所在のスキー場へのアクセス拠点となっています。鉄道を利用するスキーヤーは減少したとはいえ、雪質のよさもあって冬季はかなりの混雑となります。駅前には土産物屋や飲食店が立地しているほか、姫川に沿った国道伝いに商店が多く並んでいます。