島式1面2線から成る地平駅ですが、ホームは大きく曲がっており、なかなか見通しが悪いようです。北陸本線には珍しく、地下道で改札口へ向かいます。寺井という駅名にもかかわらず、旧寺井町ではなく旧根上町にあったことで知られていました。
駅舎は、ずいぶんと横に長い平屋のものです。駅の待合室は、地元の利用客によってていねいに使われており、座布団やたくさんの本が置いてありました。
駅前は、住宅と小商店が混在しています。私が下車したときには、地元出身のメジャーリーガー、松井秀喜選手のポスターがあふれていました。駅のすぐ脇から、旧北陸鉄道能美線の跡地を整地した歩行者自転車道が延びています。
北陸本線はここからしばらく、海に近いところを走っていきます。