安城市の南部に新設された、西尾線で最も新しい駅です。南桜井駅が開業する前には、西尾線では鎌谷、三河荻原両駅が廃止されており、人口密集地から外れた地での新駅開業は奇異にも聞こえたものですが、これは、駅予定地の西側にある自動車部品メーカー、アイシン・エィ・ダブリュへのアクセス用に設置されたものです。桜井からこの南桜井までの区間は複線になっています。
相対式ホーム2面2線から成る地平駅です。両ホームのそれぞれ吉良吉田方に改札口が設けられており、改札内での両ホームの行き来はできません。
駅集中管理システムによって遠隔管理されている無人駅ですが、ベージュを基調とした外壁に加え、ガラスを多用した円筒形の飾りを設けるなど、規格型の駅舎とは少し形態が異なります。
駅の周辺は大きな水田が延々と広がっています。